Pour les périphériques Stratix® II GX, VCCH doit être connecté à 1,2V ou 1,5V. Les versions 5.1 SP1 et SP2 du logiciel Quartus® II montrent incorrectement les broches VCCH dans des quads inutilisés connectés à 3.3V dans le fichier de conception <>rapport .pin.
Ce problème dans le fichier pinout a été résolu à partir de la version 6.0 du logiciel Quartus II.